El Río San Juan empieza en el área sureste del lago de Nicaragua (Pueblo de San Carlos) y fluye por 119 millas (199 km) al mar Caribe. Este forma la frontera natural con Costa Rica.

 El área en su totalidad es de bosque tropical lluvioso, la biodiversidad es espectacular, podrás presenciar la exuberante vegetación así como experimentar a nuestra madre naturaleza en su máximo esplendor. El río es el hábitat natural de diferentes especies de aves como: tucán de pico castaño, águila harpía, garzas, Jacanas, cormoranes. También otras especies como caimanes (cocodrilos), tortugas, monos, ranas flechas rojas, etc.

La porción recomendada para andar en canoa es desde El Castillo finalizando en San Juan de Nicaragua.

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